查看脚本使用方法:
python fastq_stats.py# FASTQ文件统计工具 (TSV矩阵输出)# ==================================================# 用法: python fastq_stats.py [选项] 文件模式...# 选项:# -p N 进程数 (1=顺序处理, 默认:自动选择)# -o FILE 输出文件名 (默认: fastq_matrix.tsv)# 示例:# python fastq_stats.py *.fastq.gz# python fastq_stats.py -p 4 *.fq *.fastq.gz
可以使用明确的文件名进行输入,也可以使用通配符输入文件夹内的所有fastq文件,这里我使用两个fastq文件进行演示:
python fastq_stats.py A1_R*.fastq.gz -p 8 -o A1_fastq_matrix.tsv