Python|Matthias Mann团队单细胞空间蛋白质组学绘制人类肝脏分区模式及其对组织结构破坏的脆弱性

    理解蛋白质分布模式在组织结构中对解读健康和疾病中的器官功能至关重要。肝脏是最大的内脏，在协调葡萄糖稳态、蛋白质合成、胆汁生成和解毒有害物质等关键过程中起着关键作用。为了高效管理这些多样的功能，肝脏进化出了独特的解剖结构。通过肝叶的定向血流——最小的功能单元——在该轴上形成明显的代谢和信号梯度。尽管肝细胞在组织学上看起来相似，但它们在小叶中的位置不同，执行的代谢功能往往截然不同，且常常相互矛盾——这一现象被称为肝区分区现象。门膜周围肝细胞主要参与糖新生和脂肪酸氧化，而中心周围肝细胞则专注于糖酵解和脂生成。肝脏分区的精确映射和更高的空间分辨率对于彻底研究肝脏生理和疾病至关重要。准确定量蛋白质作为功能参与者在肝病中尤为重要，因为肝病中翻译和翻译后调控，包括蛋白质更新，常常驱动病理过程该团队展示了单细胞深度视觉蛋白质组学在本地肝组织中对单个细胞进行空间解析蛋白质组分析的应用。该团队建立了由战略细胞选择和连续蛋白质梯度映射组成的稳健框架，支持对更大临床队列的研究。通过分析18名个体的数百个分离肝细胞，绘制了人类肝蛋白组的全面空间图。    该研究的所有分析数据及代码都是对外开放，感兴趣的老师们可以下载，欢迎一起讨论~

    分离出792个单一肝细胞形状。经过质量阈值过滤，我们确定每个形状中位数为2,539种蛋白质，最大3,926种蛋白质。