第四期:OVITO+Python建模+LAMMPS分子动力学模拟+分析方法
1. MS软件构建聚乙烯(PE)和聚苯乙烯(PS)的全原子模型及设置势函数(CVFF);
2. LAMMPS中Lennard-Jones势函数详解,cutoff的作用以及如何在平衡过程中巧妙利用它来平衡结构;
3. Python建模PE/PS层状聚合物聚合物模型;
4. 层状聚合物的bulk体系模拟、thin-film模拟;
5. 模拟中反射墙的用法;
6.利用LAMMPS计算一维、二维密度分布,以及体系内不同组分的单独MSD曲线。
分子模拟中非键相互作用Lennard-Jones势函数详解:
反射墙下体系压缩获取层状结构(原子限域盒内):
OVITO-Python:不规则界面面积与界面能计算
PE/PS的MSD与薄膜密度分布计算: