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【6.0】构建数据枢纽:Python Pandas高效管理与融合多源地质数据

  • 2026-08-26 10:33:24
【6.0】构建数据枢纽:Python Pandas高效管理与融合多源地质数据
  

本系列文章是沙特地质调查配套软件的最后一章,讲的是这套综合数据整理工具是怎么开发出来的、现在又能帮你做什么。一开始,它只是为了帮图幅负责人「合库」而开发的:当时每天有两组野外同时开展,一周下来数据量非常大,需要频繁把多期 Excel 合并在一起。我看到负责人总是一个个表格手动复制粘贴,为了把他从繁琐的数据处理中解放出来,让他能把更多精力放在宏观把控图幅调查上,就给他定制了一款合库小工具。

相比项目组提供的 ArcGIS 工具箱里的 Merge 工具,这个工具不受文件名和路径限制,任何文件夹命名都能正常合并;更重要的是,它支持多次返回修改数据,可以灵活提交图片和素描记录,保证实体图片和 Excel 记录的一致性,操作起来更顺手。后来有同事反映 ArcGIS 工具箱经常出问题,于是我索性决定彻底脱离 ArcGIS 平台:不再依赖 Arcpy,而是用开源库 GeoPandas 重新开发数据导入导出的功能。这样一来,这套软件就不再受 ArcGIS 约束,可以在纯 Python 环境下跑起来,并在此基础上逐步把「野外数据导出、SHP ↔ Excel、图片整理、数据检查」这些环节都集成进来,变成覆盖沙特野外调查全流程的一站式数据整理桌面工具,把合并、转换、整理、检查这些常用操作都集成在一个界面里,用可视化按钮替代复杂脚本。点几下按钮、选好文件夹或文件,就能完成以前要折腾半天甚至几天的工作,而且完全不依赖 ArcGIS,只要有 Python 环境,或者直接运行打包好的 exe 就能轻松使用。

下面按功能块介绍一下它能做什么、怎么用、用的时候要注意什么。


它能做什么?

工具界面按三大块排列:野外数据整理、数据检查、合库数据功能。每一块里都有对应按钮,用弹窗选择文件/文件夹即可,处理在后台进行,状态栏会显示当前进度。

一句话概括:用一款工具,替代过去「Excel + ArcGIS + 手工整理」的多软件、多步骤流程。


一、野外数据整理(三个功能)

1. 野外数据导出

  • • 作用:把野外采集的原始数据按日期和内容类型,一键导出、整理到指定目录,并自动做备份,避免原始数据被误改。
  • • 怎么用:点击「野外数据导出」,在弹窗里选择「野外数据文件夹」、填写日期(默认当天),程序会自动给出「输出文件夹」(DataClean)和「备份文件夹」(Backup);再选择导出内容:All(全部)、Location(仅位置)、Shape files(仅 Shape 文件),点「开始导出」即可。
  • • 适用场景:每天野外调查后的第一道工序,把原始数据规整到统一目录结构,便于后续合并和检查。

2. SHP 转 Excel

  • • 作用:把一个文件夹里(含子文件夹)的所有 .shp 文件,逐个转成同一个 Excel 工作簿里的不同工作表,每个 SHP 的属性表、坐标(经度/纬度)都会保留;点、线、面几何会转成坐标或中心点,方便在 Excel 里查看、修改。
  • • 怎么用:点击「SHP 转 Excel」,先选「SHP 文件夹」(程序会递归查找所有 .shp),再选「保存 Excel 的位置和文件名」,确认后自动转换;若某个 SHP 几何数据损坏(如报错 Invalid length for entity),工具会尽量只导出属性表,避免整个文件失败。
  • • 注意:每个 SHP 对应一个工作表,工作表名来自文件名(不含 .shp);Excel 工作表名有长度和字符限制,程序会自动截断和替换非法字符。

3. Excel 文件整理


二、合库数据功能(三个功能)

4. Excel 文件合并

  • • 作用:把一个目录下(含所有子目录)的多个 Excel 工作簿,按工作表名称合并成一个大工作簿:同名的表从第二行起追加在一起,表头只保留一份,适合多期、多批数据「合库」。
  • • 怎么用:点击「Excel 文件合并」,先选「包含 Excel 的目录」,再选「合并后要保存的 .xlsx 路径」;程序会递归查找所有 .xlsx 和 .xls,逐个读取、按表名合并;若存在名为「Structures」的工作表,还会按指定字段排序。合并完成后可选对表头做统一格式化(加粗、灰色背景等)。
  • • 注意:支持 .xlsx 和 .xls;若某个文件损坏或格式异常,会跳过该文件并记录在结果提示里,不影响其他文件合并。

5. 图片合并整理

  • • 作用:把散落在多个子文件夹里的 jpg 照片,按文件名关键词自动分拣到 Media/Photo 和 Media/Sketch:文件名里带 PH 的归到 Photo,带 SK 的归到 Sketch,整理完目录结构清晰,便于和 Excel 里的 Picture、Sketch 表对应。
  • • 怎么用:点击「图片合并整理」,先选「待处理图片文件夹」,再选「目标 Media 文件夹」;程序会在其下创建 Photo、Sketch 子文件夹,并移动(非复制)符合规则的 jpg 过去。支持子目录递归扫描。
  • • 注意:目标是「整理」而非备份,原位置的文件会被移走;若目标已有同名文件,会按程序逻辑处理(如覆盖或避免覆盖,以实际版本为准)。

6. Excel 转 SHP

  • • 作用:把 Excel 工作簿里的多个工作表,每个转成一个独立的 .shp 文件;程序会自动识别坐标列(经度/纬度、X/Y、或中文「经度」「纬度」),用这些列生成点几何,保存为 Shapefile,方便在 ArcGIS、QGIS 等软件里做图和分析。
  • • 怎么用:点击「Excel 转 SHP」,选择 Excel 工作簿和「SHP 保存文件夹」;每个有坐标数据的工作表会导出一个 .shp,字段名会按 SHP 要求截断或重命名(如 10 字符、字母数字下划线)。坐标列优先识别 Longitude/Latitude,其次 X/Y。
  • • 注意:工作表里必须有可识别的坐标列,否则该表会跳过;经纬度建议在 -180~180、-90~90 范围内,否则会按无坐标系处理,需在 GIS 中自行设投影。

三、数据检查功能(两个功能)

7. 图片与 Excel 记录一致性检查

  • • 作用:对比 Picture 工作表和 Sketch 工作表的 B 列(通常为照片文件名)与 Photo 文件夹、Sketch 文件夹里实际存在的 jpg,生成一份文字报告:哪些照片在文件夹里但没有在表里登记、哪些表里有记录但文件夹里没有图,方便查漏补缺。
  • • 怎么用:点击「图片与 Excel 记录一致性检查」,选择 Excel 工作簿和「要检查的照片目录」(应包含 Photo、Sketch 子目录或等效结构);程序会匹配 B 列与文件名(不区分大小写),报告显示在界面下方的「检查报告」区域。
  • • 注意:工作表名支持「Picture」「Picture.shp」「Sketch」「Sketch.shp」等常见写法,B 列应为文件名(如 38263B064_PH09.jpg),程序会自动补 .jpg 做匹配。

8. 删除多余照片

  • • 作用:在「一致性检查」的基础上再进一步:找出文件夹里有、但 Excel 里没有任何记录的照片,列出清单,经用户确认后一键删除,减少冗余文件,节省空间并降低混淆。
  • • 怎么用:点击「删除多余照片」,选择 Excel 工作簿和 Media 目录;程序会列出 Photo、Sketch 下「多余」的文件,弹窗确认是否删除;确认后执行删除,并在报告区显示结果。删除不可恢复,建议先备份或确认清单无误再点确认。

典型使用场景(可以怎么搭配用)

  • • 每天野外调查回来:先用「野外数据导出」整理原始数据并备份 → 需要给甲方或汇报用表格时,用「SHP 转 Excel」把各类 SHP 导出到一张 Excel。
  • • 多期数据合库:用「Excel 文件合并」把多期 Excel 合成一本 → 用「Excel 文件整理」统一表头和字体。
  • • 照片和表格对账:用「图片合并整理」把照片归到 Photo/Sketch → 用「图片与 Excel 记录一致性检查」看是否缺图或缺记录 → 用「删除多余照片」清理无记录的照片。
  • • 从表格到地图:用「Excel 转 SHP」把带坐标的 Excel 表转成 SHP,再在 GIS 里制图或分析。

实现原理与技术栈

  • • 主语言与运行方式
    • • 使用 Python 3.8+ 开发,核心逻辑集中在 main.py。
    • • 通过 PyInstaller 打包为 SGS项目数据整理工具.exe,方便在无 Python 环境的电脑上直接运行。
  • • 桌面界面与交互架构
    classGeologyToolApp(ctk.CTk):def__init__(self):super().__init__()self.create_field_data_export_row()  # 野外数据整理self.create_second_row()             # 数据检查功能self.create_first_row()              # 合库数据功能defupdate_status(self, text, status_type="info"):# 统一更新底部状态栏与颜色        ...
    • • 基于 tkinter + customtkinter 实现深色风格 GUI,GeologyToolApp 作为主窗口类,按「野外数据整理 / 数据检查 / 合库数据功能」三大区域布置按钮。
    • • 按钮只负责收集参数 + 启动后台任务,真正的耗时操作(读写 Excel、SHP、扫描目录等)放在 threading.Thread 里执行,避免界面无响应。
    • • 底部状态栏统一显示「正在执行…」「系统就绪」等状态信息,野外导出时还会把 FieldDataExport_geopandas.py 的日志重定向到界面状态。
  • • 数据处理与文件读写
    • • Excel:pandas + openpyxl / xlrd,封装了 read_excel_file(),自动根据扩展名选择引擎,既兼容 .xlsx 又能在安装 xlrd 后读 .xls。
    • • SHP 与空间数据:geopandas + shapely,在「SHP 转 Excel」「Excel 转 SHP」「野外数据导出」中统一使用;支持点、线、面几何,必要时只导出属性表以绕过损坏记录。
    • • 图片与文件系统:Pillow 处理照片 DPI 和 EXIF,os / pathlib.Path / shutil 用于移动、备份和合并照片,以及建立 DataClean、Backup、Media/Photo、Media/Sketch 等目录结构。
    • • 其他:个别场景使用 sqlite3、csv、numpy 等库,在 FieldDataExport_geopandas.py 中对原始野外数据做更精细的转换与校正。
  • • 模块拆分与复用
    def_run_field_data_export(self, fieldfd, date, outfd, backupfd, content):# 动态导入 FieldDataExport_geopandas 模块    spec = importlib.util.spec_from_file_location("FieldDataExport_geopandas", field_export_module_path    )    module = importlib.util.module_from_spec(spec)# 将模块中的消息输出映射到 UI 状态栏    module.AddMessage = lambda msg: self.update_status(str(msg), "processing")    module.AddWarning = lambda msg: self.update_status(f"警告: {msg}", "warning")    module.AddError =   lambda msg: self.update_status(f"错误: {msg}",  "error")    spec.loader.exec_module(module)    module.main(fieldfd, date, outfd, backupfd, content)
    • • 所有 Excel/SHP/图片相关操作都封装成独立方法(如 shp_to_excel、merge_excel_files、merge_images、excel_to_shp 等),便于后续在不改界面的前提下扩展或替换内部实现。
    • • 野外导出逻辑单独放在 FieldDataExport_geopandas.py 中,主界面通过 importlib.util.spec_from_file_location 动态加载,并把 AddMessage/Warning/Error 这类输出函数重定向到 GUI:

整体上,这是一套**「界面层(customtkinter) + 任务调度层(线程 + 状态栏) + 业务逻辑层(Excel/SHP/图片处理函数)」**分离的架构,既照顾非技术用户的易用性,又方便技术同事阅读、修改和二次开发。


怎么用?环境要求与获取方式

方式一:直接运行 exe(推荐给非开发人员)

  • • 在发布包中找到 「SGS项目数据整理工具.exe」,双击运行即可。
  • • 界面为深色地质风格,上方是各功能按钮,下方是检查报告区域和状态栏;点击对应按钮后,按弹窗提示选择文件或文件夹,处理在后台进行,状态栏会显示「正在…」「系统就绪」等状态。
  • • 若杀毒软件报警,多为误报(打包工具生成 exe 常见),可添加信任或从可靠渠道获取 exe。

方式二:用 Python 源码运行

  • • 需要 Python 3.8 或更高版本。
  • • 基础功能(Excel 合并、图片整理、Excel 整理、一致性检查、删除多余照片):安装项目里的 requirements.txt 依赖即可(如 pandas、openpyxl、customtkinter 等),运行 python main.py。
  • • 地理相关功能(野外数据导出、SHP 转 Excel、Excel 转 SHP):还需安装 geopandas。Windows 上建议用 conda:conda install -c conda-forge geopandas;或从第三方站点下载 GDAL、Fiona 的 wheel 再 pip install geopandas,详见项目内的安装说明或 install_geopandas.bat。
  • • 不安装 geopandas 也可以正常使用除上述三项以外的所有功能。

注意事项小结

  • • Excel 转 SHP:工作表里必须有可识别的坐标列(经度/纬度或 X/Y),否则该表无法导出为 SHP。
  • • 一致性检查 / 删除多余照片:Excel 中需有 Picture、Sketch 工作表(或 Picture.shp、Sketch.shp),B 列为照片文件名;照片目录结构建议包含 Photo、Sketch 子目录。
  • • 图片合并整理:会移动文件而非复制,重要照片请先备份;分拣规则为文件名含 PH → Photo,含 SK → Sketch。
  • • 合并与整理:合并会递归扫描子目录下所有 Excel;整理会直接修改所选 Excel 文件,建议先备份。

小结

SGS 项目数据整理工具把野外数据导出、Excel 与 SHP 互转、多表合并、照片分拣、表头统一、记录与照片对账、多余照片清理集中在一个窗口里,适合作为项目每周合库、交成果前的标准化数据处理工具。


沙特地质手记:在时间与沙砾之间
【1.0】告别手动熬夜:Excel VBA如何将沙特填图路线整理效率提升300%
【1.1-Picture工具集】一套工具搞定表格格式、删除多余记录、添加比例尺、照片镜头向、素描引用等多项功能
【1.2-Structure工具集】一套工具搞定表格顺序、多表信息合并、赤平投影等多项功能
【1.3-Sketch工具集】一套工具搞定新建 Sketch 表、筛选素描照片、重编号 SK、更新路径、重命名图片、图片引用等多项功能
【1.4-Alt_mineral工具集】一套工具搞定新建 Alt_mineral 表、调整表格顺序、统一经纬度格式等多项功能
【1.5-Point工具集】一套工具搞定数据汇总,实现多表格同步更新等核心功能
【2.0】岩石定名投图工具集:专为沙特地盾区开发的中英文辅助工具
【2.1-岩浆岩投图工具】 QAP一键投图,支持中英对照、暗色矿物自动标准化
【2.2-火山碎屑岩投图工具】 BLA一键投图、支持中英对照、成分复制与无模式窗体操作
【2.3-凝灰质岩类分类定名】 集成国际标准图示,支持名称一键复制与无模式窗体操作
【2.4-变质岩分类定名工具】 遵循国际惯例,支持名称一键复制与无模式窗体操作
【2.5-构造岩分类定名工具】 集成国际标准图示,支持名称一键复制与无模式窗体操作
【2.6-碎屑岩投图工具】GMS一键投图,支持中英对照,可复制成分
【2.7-杂砂岩投图工具】QFR一键投图,支持中英对照, 无模式窗体,支持Matrix校正
【2.8-净砂岩投图工具】QFR一键投图,支持中英对照, 无模式窗体,支持Matrix校正
【2.9-碳酸盐岩分类定名工具】集成Lokier & Al Junaibi (2016)方案,支持边操作边查阅
【2.10-第四系分类定名工具】用于第四系沉积与地貌的分类与命名,无模式窗体
【3.0】解放绘图生产力:自研CorelDRAW自动化菜单,让素描图与剖面图实现“流水线”作业
【3.1】地质素描智能成图:一键批量,秒级输出,重新定义绘图效率
【3.2】数据驱动绘图:信手剖面图自动生成,让地质数据“秒变”可视化图纸
【4.0】地质“活字典”:基于Excel VBA构建可维护的万能标准库
【5.0】数据质控“守门员”:Excel VBA脚本自动排查路线逻辑错误
【5.1-文本检查工具】一套工具搞定形式检查,单词拼写英语语法等多项检查
【5.2-一致性检查工具】一套工具搞定图片引用、图片与记录一致性查,矿物成分、含量等等多项检查
【5.3-Structures检查工具】一套工具搞定数据一致性,Meta 不匹配等二十余项构造专项检查

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