linux下通过 VS Code + Remote SSH来使用R
- 2026-04-17 01:48:17
linux下通过 VS Code + Remote SSH来使用R
第一步 在自己电脑上安装VS Code
1、安装什么版本的VS Code，这是踩的第一个坑，由于课题组服务器的linux系统比较老旧一些，最新版本的VS Code是不能通过Remote SSH来远程连接的。
根据我使用的CentOS 7系统，选择下载 1.85.2 版本的 VS Code进行安装，下载安装包后按提示安装，记得先卸载旧版本（打开“设置” -> “应用”，找到 Visual Studio Code，点击卸载。）。
https://update.code.visualstudio.com/1.85.2/win32-x64-user/stable
2、安装好后，打开软件，点击左下角设置，在弹出来的搜索框中输入update mode 然后选择none，避免自动更新软件
第二步 确认电脑可以通过cmd远程连接服务器
这是第二个坑，即便以前使用Xftp这类软件完全可以连接到服务器，但是使用windows cmd不一定，如果不解决的话，VS Code也是不能远程连接上的。
打开CMD，输入
ssh -v 用户名@你的服务器IP
果然报错：
OpenSSH_for_Windows_8.1p1, LibreSSL 3.0.2
Bad owner or permissions on C:\\Users\\Administrator/.ssh/config
修复步骤（几分钟即可搞定）：
找到文件： 打开电脑的资源管理器（文件夹），进入路径 C:\Users\Administrator\.ssh。
打开高级安全设置： 右键点击 config 文件 -> 选择属性 -> 切换到安全选项卡 -> 点击下方的高级按钮。
禁用继承（切断多余权限）： * 在弹出的高级配置窗口底部，点击禁用继承（Disable inheritance）。
系统会弹出一个警告框，选择**“从此对象中删除所有已继承的权限”**（这会清空上面列表里的所有用户）。
添加你的专属权限：
点击添加按钮 -> 点击左上角的选择主体。
在下方输入框中输入你的用户名 Administrator -> 点击检查名称（系统会自动核对并加上下划线） -> 点击确定。
在权限勾选框中，勾选完全控制 -> 点击确定。
保存并退出： 此时检查一下，权限列表里应该只有 Administrator 这一个用户（如果有 SYSTEM 也可以保留，但绝对不能有 Everyone 或其他杂乱的组）。一路点击确定保存并关闭所有属性窗口。
再次返回CMD，输入ssh -v 用户名@你的服务器IP，将会提示输入密码。
第三步 通过VS Code连接服务器
1、安装Remote SSH，在左侧的插件市场（Extensions，快捷键 Ctrl+Shift+X）中搜索并安装插件：Remote - SSH。
2、安装好后，需要将该插件也降级，点卸载旁边的小箭头选择并选择 0.108.0 或者 0.106.1安装。
3、按下 F1 或 Ctrl+Shift+P或点击那个蓝色的 >< 图标，输入 Remote-SSH: Connect to Host...。输入你平时登录服务器的 SSH 命令（例如 ssh 用户名@你的服务器IP），按回车并输入密码。连接成功后，VS Code 的左下角会显示绿色的 SSH 状态。
第四步 打开服务器上的“工作目录”
点击左侧欢迎界面上的 “打开文件夹...” (Open Folder...)。
顶部会弹出一个路径输入框，默认应该是个人用户主目录（比如 /home/XXX/XXX/）。
直接点击确定 (OK)。
会需要二次输入密码
此时，左侧边栏就会显示你服务器上的所有文件了！这就是文件浏览区
第四步 安装R插件
1、首先在终端这里激活之前安装在个人账户下的conda R环境，为啥这么说呢，因为我用VS Code连接服务器用R的原因就是linux本身安装RStudio后，是全局安装，只能使用一个R，要么是系统安装的R，要么是你自己在conda环境下安装的R，系统的R，很难用，但是用自己账户的R影响别人，所以就想切换到VS Code连接服务器用R，使用界面和RStudio很像，但是又可以用自己账号下安装的conda环境下的R。
mamba activate spatial_r_env mamba install -c conda-forge r-languageserver r-httpgd
2、插件区找到R，然后点击安装，哈哈哈哈，不出意外，又是不能安装，还是需要安装一个低版本的插件，这次需要通过终端安装。
code-server --install-extension REditorSupport.r@2.8.1安装成功后的标志：左侧边栏会出现一个 “R”图标。
第五步 检查是否可用
1、点击左上角的文件图标，在空白处右击新建一个文件，命名为test.R，在右侧的代码编辑区，输入以下内容。#检查环境和画图
print("Hello, ArchR!")x <- rnorm(100)plot(x, main="My First Server Plot")
此时操作就像RStudio了，鼠标点在第一行上，按CTRL+回车，就会运行，并自动跳下一行，当然需要先从在下方的终端区进入R，输入R回车，变为>即可。
2、遇到问题解决，不能够出现图片，检查发现下方显示R没有连接，点击这个图标，还会弹出报错。
首先，安装vscDebugger，通过本地安装，
本地下载： 在你的 Windows 电脑浏览器里打开：https://github.com/ManuelHentschel/vscDebugger/archive/refs/heads/master.zip
上传服务器： 把下载好的 master.zip 通过 Xftp 或 VS Code 左侧文件面板拖进服务器的文件夹里。
cd /home/xxxxx/# 解压 ZIP 包
unzip vscDebugger-master.zip# 重新打包成 R 认识的 .tar.gz 格式
tar -czvf vscDebugger.tar.gz vscDebugger-master/install.packages("/home/XXXX/vscDebugger.tar.gz", repos = NULL, type = "source")
其次，修改R插件设置
点击这里，打开设置，找到以下选项勾选，并在这两个位置添加自己的R地址，在R控制台输入
file.path(R.home("bin"), "R")，将返回的地址粘贴进去，不用加引号
退出当前的R，然后重新激活之前的conda环境，输入R回车，
install.packages(c("jsonlite", "rlang"))退出R，在终端
vi ~/.Rprofilesource(file.path(Sys.getenv(if (.Platform$OS.type == "linux") "USERPROFILE" else "HOME"), ".vscode-R", "init.R"))
保存后退出，然后重新打开vs code，进入服务器，激活环境，进入R，然后就解决了
不一定完美，但是问题解决了，嘻嘻
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