前面给大家带来了Linux在生物信息学中的重要性,为什么学Linux,怎么去学习等内容。今天的内容主要介绍了在生物信息学分析中常用的30个Linux命令行操作,这些命令是进行生信分析的基础,基本上是单词的简写。希望这些内容能帮助大家更好地掌握Linux系统,提高生物信息学分析的效率和水平。
ls
ls -l
ls -a
cd /path/to/directory
cd ..
pwd
mkdir new_directory
touch new_file.txt
cp file1.txt file2.txt
cp -r directory1 directory2
mv file1.txt /path/to/directory
mv old_name.txt new_name.txt
rm file.txt
rm -r directory
cat file.txt
more file.txt
less file.txt
head file.txt
tail file.txt
find /path/to/search -name "filename"
grep "search_text" file.txt
wc file.txt
diff file1.txt file2.txt
tar -cvf archive.tar file1 file2
tar -xvf archive.tar
ps
ps aux
top
kill PID
df -h
du -h /path/to/directory
free -h
ping www.example.com
ifconfig
ip addr show
ss -tuln
nc -vz host port
curl -O http://www.example.com/file.txt
wget http://www.example.com/file.txt
chmod 755 file.txt
chown user:group file.txt
sudo command
history
#可以通过给命令起一个简短的别名来快速执行该命令。比如:
alias ll='ls -l'#这样以后输入ll就相当于输入了ls -l。
#一般格式为年-月-日 时:分:秒。
#可以用来查看当前系统的时间设置。
date
#通过该命令可以查看系统已经运行的时间长短,以及系统在过去1分钟、5分钟、15分钟内的平均负载情况。
uptime
以上是我们常用命令的简介和示例,需要具体命令的选项参数还需要去输入 命令 --help或者-h来查看具体的帮助文档,关于该命令的详细示例和信息。
下期内容:转录组上游分析
此文是在自己的理解和参考网络资料后完成的,若有侵权,请联系删除。

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