单细胞Figure1的常见图表(Python版)

学习手册以html文件格式提供，可在浏览器中打开并翻阅学习：‍

教程目录：

一、文献解读

1.1背景介绍

1.2 主要内容

（1）scRNA-seq揭示正常瘢痕和纤维性皮肤病真皮组织的细胞异质

（2）瘢痕疙瘩和正常瘢痕中成纤维细胞形成不同的细胞亚群

（3）纤维化皮肤病中间充质成纤维细胞特征的鉴定

（4）成纤维细胞亚群中的配体-受体相互作用分析

（5）间充质成纤维细胞通过POSTN促进瘢痕中胶原蛋白表达

（6）sC4 成纤维细胞比 sC1 成纤维细胞更像间充质细胞

（7）间充质成纤维细胞在硬皮病中增加

1.3 总结讨论

二、准备工作

2.1 数据下载

2.2 数据读入

三、数据处理和可视化

3.1 数据质控及可视化

3.2 细胞分群

3.3 细胞类型注释

3.4 降维图

3.5 小提琴图

3.6 基因表达在降维图展示

3.7 细胞比例展示

3.8 差异基因相关

     3.8.1 差异基因计算

     3.8.2 差异基因点图

     3.8.3 差异基因热图

     3.8.4 差异基因热图优化

3.9 火山图

3.10 差异基因富集分析

3.11 每个亚群组间差异基因柱形图

3.12 拼图

      3.12.1 第一层

      3.12.2 完整fig1

      3.12.3 小结

文末下载链接中包含以下内容：

测试文件约15.12GB，大家注意按需下载！