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Python学习 | 目录

最终课程结构：20 Lessons

阶段	Lesson	核心内容
I. Python 基础与 R→Python 迁移	01	Python 世界观：变量、对象、基础类型、运算
	02	String：index、slice、字符串方法、DNA/RNA 序列
	03	List / Tuple：序列容器、mutable / immutable、引用与复制
	04	Dictionary / Set：key-value、去重、membership
	05	控制流程：if / for / while / range / enumerate
	06	Pythonic iteration：comprehension、zip、迭代思维
II. 生物信息学编程基础	07	Function：参数、return、scope、异常处理
	08	文件与路径：with open、pathlib、文本解析
	09	FASTA / FASTQ：parser、generator、大文件流式处理
	10	Module / package / collections：Counter、defaultdict、科研脚本组织
III. 科学计算与数据分析	11	NumPy：ndarray、indexing、shape、dtype、vectorization
	12	NumPy 高维数据：axis、broadcasting、matrix、boolean indexing
	13	Pandas：DataFrame、筛选、groupby、merge；R/tidyverse 对照
IV. Genomics algorithms & assembly	14	Sequence algorithms：GC、motif、Hamming、translation、ORF
	15	k-mer：生成、计数、频率、Counter、复杂度
	16	Graph：adjacency list、degree、overlap graph、de Bruijn graph
	17	Genome assembly：Eulerian cycle/path、sequence reconstruction
	18	Genomics Python 实战：Biopython、FASTA/FASTQ/BED/VCF/BAM 思维
V. Genomic deep learning	19	NumPy → PyTorch：Tensor、sequence encoding、Dataset/DataLoader
	20	Genomic deep learning：MLP/CNN/Attention/Transformer + 综合项目