392.富集分析综合代码,KEGG、GO BP、GO CC、GO MF、DO、Reactome,自动组图
【392.富集分析综合代码，KEGG、GO BP、GO CC、GO MF、DO、Reactome，自动组图】 https://www.bilibili.com/video/BV1sKz9BxEXQ/?share_source=copy_web&vd_source=118c2518bdc74f73bb53a2f3dbffd8be
用的R包：clusterProfiler、org.Hs.eg.db、enrichplot、ggplot2、RColorBrewer、circlize、DOSE、ReactomePA、reactome.db、tidyverse、magick、cowplot、stringr。基因ID转换与富集分析：输入基因符号通过org.Hs.eg.db数据库映射为Entrez ID。采用clusterProfiler包进行多数据库富集分析，包括KEGG通路富集、Gene Ontology (GO)富集分析（分为生物学过程BP、细胞成分CC、分子功能MF三个本体）、Reactome通路富集分析和疾病本体(DO)富集分析。所有富集分析均采用Benjamini-Hochberg (BH)方法进行多重假设检验校正。p值阈值设定为0.05，富集分析结果按p.adjust值升序排列，取前10条通路用于可视化。
